Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 SNX18P25-201ENST00000510539 758 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC026992.2-201ENST00000570122 766 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AL662797.2-201ENST00000607333 527 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC243919.1-201ENST00000613086 785 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC243571.1-201ENST00000615743 478 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 LINC02341-202ENST00000637462 1295 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 ARRDC3-201ENST00000265138 4188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 SLC4A10-204ENST00000421911 3398 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 MAPK10-344ENST00000641718 3746 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 KIAA0232-202ENST00000425103 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AL353763.1-201ENST00000624467 1628 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC011592.1-201ENST00000624647 3634 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 PIGN-207ENST00000586566 3891 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 LINC00347-202ENST00000594461 2371 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 RNF146-215ENST00000616343 2077 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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FOXF2Q12947 OR52N5-201ENST00000317093 1034 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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FOXF2Q12947 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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FOXF2Q12947 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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FOXF2Q12947 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 RN7SL104P-201ENST00000498686 293 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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FOXF2Q12947 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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FOXF2Q12947 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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FOXF2Q12947 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC015818.6-201ENST00000584274 634 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 ZNF675-208ENST00000601010 669 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AL078623.1-201ENST00000602702 907 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AL953862.2-201ENST00000603089 820 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AL445649.1-201ENST00000615941 691 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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