Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 C2CD6-203ENST00000439802 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 CNTN4-AS1-201ENST00000442749 1640 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 ZNF600-201ENST00000338230 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 FGD4-202ENST00000427716 8242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 TRIM49B-202ENST00000622138 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 CSDE1-214ENST00000530886 3459 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 BCL2L14-201ENST00000266434 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC131182.1-201ENST00000509184 657 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 IGHV3-57-201ENST00000520143 280 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 MLIP-201ENST00000274897 1815 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 PDGFC-203ENST00000502773 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 HDAC2-AS2-208ENST00000519104 2016 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 DNMBP-203ENST00000543621 4178 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 LINC00598-215ENST00000638084 1974 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 FYB1-209ENST00000512982 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 RPL5P5-201ENST00000392009 893 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 RPL5P9-201ENST00000448118 886 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC026826.1-201ENST00000493002 361 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 LINC01991-202ENST00000446091 1524 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 RASGEF1B-214ENST00000638048 2386 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 GAPVD1-215ENST00000470056 8923 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 VN1R1-201ENST00000321039 2353 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC087430.1-201ENST00000451707 3699 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 DRP2-204ENST00000538510 6852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 OR7D4-202ENST00000641244 4968 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 NAA15-208ENST00000515576 2456 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC016813.1-201ENST00000521511 735 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 CRYAB-207ENST00000527950 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 GOLGB1-209ENST00000614479 11115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 GPRIN3-201ENST00000333209 6260 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 MEF2C-244ENST00000636998 5936 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC020658.2-201ENST00000559030 4020 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 FANCD2-201ENST00000287647 5219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 NRIR-201ENST00000366140 799 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC092375.1-201ENST00000550410 637 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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