Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CENPFP49454 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
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CENPFP49454 ZNF699-201ENST00000308650 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CENPFP49454 ZNF407-202ENST00000309902 5595 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CENPFP49454 ZNF271P-201ENST00000399070 5124 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CENPFP49454 SEMA3E-201ENST00000307792 6476 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CENPFP49454 ERCC6-201ENST00000355832 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
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CENPFP49454 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CENPFP49454 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CENPFP49454 AC107067.1-201ENST00000500009 1654 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CENPFP49454 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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CENPFP49454 PDGFC-203ENST00000502773 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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CENPFP49454 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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CENPFP49454 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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CENPFP49454 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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CENPFP49454 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CENPFP49454 AC015818.6-201ENST00000584274 634 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
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CENPFP49454 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CENPFP49454 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CENPFP49454 KIAA1217-207ENST00000396445 5706 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CENPFP49454 AC092807.3-203ENST00000467530 2745 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CENPFP49454 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CENPFP49454 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CENPFP49454 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CENPFP49454 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CENPFP49454 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CENPFP49454 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CENPFP49454 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CENPFP49454 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CENPFP49454 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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