Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 SEPT14P1-201ENST00000458703 648 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 AC025871.2-201ENST00000522589 511 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 AL161457.2-202ENST00000629161 743 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 MIR551B-201ENST00000384984 96 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 CAV1-203ENST00000393468 845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 MIR4435-2HG-203ENST00000409569 514 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 MAGI2-AS3-210ENST00000448636 798 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 AC019084.1-201ENST00000457337 432 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 AL137224.1-201ENST00000527984 389 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 TDGP1-201ENST00000543961 1229 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 AC013640.1-201ENST00000565366 565 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 LIPF-201ENST00000238983 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 AC011346.1-201ENST00000638059 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTGFRP43088 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.8 ms