Protein–RNA interactions for Protein: U3KPZ7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,027 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KPZ7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
U3KPZ7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
U3KPZ7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
U3KPZ7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
U3KPZ7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
U3KPZ7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
U3KPZ7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
U3KPZ7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
U3KPZ7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
U3KPZ7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
U3KPZ7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
U3KPZ7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
U3KPZ7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
U3KPZ7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
U3KPZ7 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
U3KPZ7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
U3KPZ7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
U3KPZ7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
U3KPZ7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
U3KPZ7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
U3KPZ7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
U3KPZ7 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
U3KPZ7 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
U3KPZ7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
U3KPZ7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
U3KPZ7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
U3KPZ7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
U3KPZ7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
U3KPZ7 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
U3KPZ7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
U3KPZ7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
U3KPZ7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
U3KPZ7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
U3KPZ7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
U3KPZ7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
U3KPZ7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
U3KPZ7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
U3KPZ7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
U3KPZ7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
U3KPZ7 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
U3KPZ7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
U3KPZ7 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
U3KPZ7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
U3KPZ7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
U3KPZ7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
U3KPZ7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
U3KPZ7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
U3KPZ7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
U3KPZ7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
U3KPZ7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
U3KPZ7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
U3KPZ7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
U3KPZ7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
U3KPZ7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
U3KPZ7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
U3KPZ7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
U3KPZ7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
U3KPZ7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
U3KPZ7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
U3KPZ7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
U3KPZ7 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
U3KPZ7 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
U3KPZ7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
U3KPZ7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
U3KPZ7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
U3KPZ7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
U3KPZ7 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
U3KPZ7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
U3KPZ7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
U3KPZ7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
U3KPZ7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
U3KPZ7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
U3KPZ7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
U3KPZ7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
U3KPZ7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
U3KPZ7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
U3KPZ7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
U3KPZ7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
U3KPZ7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
U3KPZ7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
U3KPZ7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
U3KPZ7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
U3KPZ7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
U3KPZ7 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
U3KPZ7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
U3KPZ7 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
U3KPZ7 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
U3KPZ7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
U3KPZ7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
U3KPZ7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
U3KPZ7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
U3KPZ7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
U3KPZ7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
U3KPZ7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
U3KPZ7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
U3KPZ7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
U3KPZ7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
U3KPZ7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
U3KPZ7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
U3KPZ7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms