Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARFGEF1Q9Y6D6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARFGEF1Q9Y6D6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms