Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms