Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms