Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RCE1Q9Y256 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RCE1Q9Y256 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms