Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SAMD4AQ9UPU9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SAMD4AQ9UPU9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms