Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PHF8Q9UPP1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHF8Q9UPP1 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms