Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ2

SYNRG, Synergin gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNRGQ9UMZ2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNRGQ9UMZ2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms