Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNMA3Q9UL41 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNMA3Q9UL41 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms