Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK99

FBXO3, F-box only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO3Q9UK99 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FBXO3Q9UK99 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms