Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TSKSQ9UJT2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSKSQ9UJT2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSKSQ9UJT2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSKSQ9UJT2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSKSQ9UJT2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TSKSQ9UJT2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSKSQ9UJT2 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSKSQ9UJT2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TSKSQ9UJT2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSKSQ9UJT2 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSKSQ9UJT2 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TSKSQ9UJT2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSKSQ9UJT2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSKSQ9UJT2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSKSQ9UJT2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSKSQ9UJT2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSKSQ9UJT2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSKSQ9UJT2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSKSQ9UJT2 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSKSQ9UJT2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSKSQ9UJT2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSKSQ9UJT2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TSKSQ9UJT2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSKSQ9UJT2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSKSQ9UJT2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSKSQ9UJT2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSKSQ9UJT2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSKSQ9UJT2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSKSQ9UJT2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSKSQ9UJT2 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TSKSQ9UJT2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSKSQ9UJT2 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSKSQ9UJT2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSKSQ9UJT2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSKSQ9UJT2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSKSQ9UJT2 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TSKSQ9UJT2 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSKSQ9UJT2 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSKSQ9UJT2 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSKSQ9UJT2 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSKSQ9UJT2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSKSQ9UJT2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSKSQ9UJT2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSKSQ9UJT2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSKSQ9UJT2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSKSQ9UJT2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSKSQ9UJT2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSKSQ9UJT2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSKSQ9UJT2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSKSQ9UJT2 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSKSQ9UJT2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSKSQ9UJT2 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms