Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MED13Q9UHV7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms