Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DKK4Q9UBT3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DKK4Q9UBT3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms