Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RRBP1Q9P2E9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RRBP1Q9P2E9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms