Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ3

GTSE1, G2 and S phase-expressed protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTSE1Q9NYZ3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTSE1Q9NYZ3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTSE1Q9NYZ3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTSE1Q9NYZ3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTSE1Q9NYZ3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTSE1Q9NYZ3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTSE1Q9NYZ3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTSE1Q9NYZ3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTSE1Q9NYZ3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTSE1Q9NYZ3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTSE1Q9NYZ3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTSE1Q9NYZ3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTSE1Q9NYZ3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTSE1Q9NYZ3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTSE1Q9NYZ3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTSE1Q9NYZ3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTSE1Q9NYZ3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTSE1Q9NYZ3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTSE1Q9NYZ3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTSE1Q9NYZ3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GTSE1Q9NYZ3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTSE1Q9NYZ3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTSE1Q9NYZ3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTSE1Q9NYZ3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTSE1Q9NYZ3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTSE1Q9NYZ3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTSE1Q9NYZ3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTSE1Q9NYZ3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTSE1Q9NYZ3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTSE1Q9NYZ3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTSE1Q9NYZ3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTSE1Q9NYZ3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTSE1Q9NYZ3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTSE1Q9NYZ3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTSE1Q9NYZ3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTSE1Q9NYZ3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTSE1Q9NYZ3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTSE1Q9NYZ3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTSE1Q9NYZ3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTSE1Q9NYZ3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTSE1Q9NYZ3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTSE1Q9NYZ3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTSE1Q9NYZ3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTSE1Q9NYZ3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTSE1Q9NYZ3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTSE1Q9NYZ3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTSE1Q9NYZ3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GTSE1Q9NYZ3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GTSE1Q9NYZ3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GTSE1Q9NYZ3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GTSE1Q9NYZ3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GTSE1Q9NYZ3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GTSE1Q9NYZ3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GTSE1Q9NYZ3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GTSE1Q9NYZ3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTSE1Q9NYZ3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTSE1Q9NYZ3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTSE1Q9NYZ3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTSE1Q9NYZ3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTSE1Q9NYZ3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTSE1Q9NYZ3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTSE1Q9NYZ3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTSE1Q9NYZ3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTSE1Q9NYZ3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTSE1Q9NYZ3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GTSE1Q9NYZ3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTSE1Q9NYZ3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTSE1Q9NYZ3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTSE1Q9NYZ3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTSE1Q9NYZ3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTSE1Q9NYZ3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTSE1Q9NYZ3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTSE1Q9NYZ3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTSE1Q9NYZ3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTSE1Q9NYZ3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GTSE1Q9NYZ3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTSE1Q9NYZ3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTSE1Q9NYZ3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTSE1Q9NYZ3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTSE1Q9NYZ3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTSE1Q9NYZ3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTSE1Q9NYZ3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTSE1Q9NYZ3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTSE1Q9NYZ3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GTSE1Q9NYZ3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTSE1Q9NYZ3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTSE1Q9NYZ3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTSE1Q9NYZ3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTSE1Q9NYZ3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTSE1Q9NYZ3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTSE1Q9NYZ3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GTSE1Q9NYZ3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTSE1Q9NYZ3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTSE1Q9NYZ3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTSE1Q9NYZ3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTSE1Q9NYZ3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTSE1Q9NYZ3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTSE1Q9NYZ3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTSE1Q9NYZ3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTSE1Q9NYZ3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms