Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB8

HOMER2, Homer protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER2Q9NSB8 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOMER2Q9NSB8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms