Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KCNIP2Q9NS61 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms