Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
LTBP3Q9NS15 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LTBP3Q9NS15 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms