Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPRSS4Q9NRS4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPRSS4Q9NRS4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPRSS4Q9NRS4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPRSS4Q9NRS4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPRSS4Q9NRS4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPRSS4Q9NRS4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPRSS4Q9NRS4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPRSS4Q9NRS4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPRSS4Q9NRS4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPRSS4Q9NRS4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPRSS4Q9NRS4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPRSS4Q9NRS4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPRSS4Q9NRS4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPRSS4Q9NRS4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPRSS4Q9NRS4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPRSS4Q9NRS4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPRSS4Q9NRS4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPRSS4Q9NRS4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPRSS4Q9NRS4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPRSS4Q9NRS4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPRSS4Q9NRS4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPRSS4Q9NRS4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPRSS4Q9NRS4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPRSS4Q9NRS4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPRSS4Q9NRS4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPRSS4Q9NRS4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPRSS4Q9NRS4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPRSS4Q9NRS4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPRSS4Q9NRS4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPRSS4Q9NRS4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPRSS4Q9NRS4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPRSS4Q9NRS4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPRSS4Q9NRS4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPRSS4Q9NRS4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPRSS4Q9NRS4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPRSS4Q9NRS4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPRSS4Q9NRS4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPRSS4Q9NRS4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPRSS4Q9NRS4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPRSS4Q9NRS4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPRSS4Q9NRS4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPRSS4Q9NRS4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPRSS4Q9NRS4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPRSS4Q9NRS4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPRSS4Q9NRS4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPRSS4Q9NRS4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPRSS4Q9NRS4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPRSS4Q9NRS4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPRSS4Q9NRS4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPRSS4Q9NRS4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPRSS4Q9NRS4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPRSS4Q9NRS4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPRSS4Q9NRS4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPRSS4Q9NRS4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPRSS4Q9NRS4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms