Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAPOLBQ9NRJ5 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms