Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TULP4Q9NRJ4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TULP4Q9NRJ4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms