Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
FZD3Q9NPG1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FZD3Q9NPG1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms