Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP29Q9HBJ7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
USP29Q9HBJ7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
USP29Q9HBJ7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP29Q9HBJ7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP29Q9HBJ7 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP29Q9HBJ7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP29Q9HBJ7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP29Q9HBJ7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP29Q9HBJ7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP29Q9HBJ7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP29Q9HBJ7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
USP29Q9HBJ7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP29Q9HBJ7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP29Q9HBJ7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
USP29Q9HBJ7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP29Q9HBJ7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP29Q9HBJ7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP29Q9HBJ7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP29Q9HBJ7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP29Q9HBJ7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP29Q9HBJ7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP29Q9HBJ7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP29Q9HBJ7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP29Q9HBJ7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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