Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6S0

YTHDC2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC2Q9H6S0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
YTHDC2Q9H6S0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
YTHDC2Q9H6S0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
YTHDC2Q9H6S0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
YTHDC2Q9H6S0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
YTHDC2Q9H6S0 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
YTHDC2Q9H6S0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
YTHDC2Q9H6S0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
YTHDC2Q9H6S0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
YTHDC2Q9H6S0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
YTHDC2Q9H6S0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
YTHDC2Q9H6S0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
YTHDC2Q9H6S0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
YTHDC2Q9H6S0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
YTHDC2Q9H6S0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
YTHDC2Q9H6S0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
YTHDC2Q9H6S0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
YTHDC2Q9H6S0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
YTHDC2Q9H6S0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
YTHDC2Q9H6S0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
YTHDC2Q9H6S0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
YTHDC2Q9H6S0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
YTHDC2Q9H6S0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
YTHDC2Q9H6S0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
YTHDC2Q9H6S0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
YTHDC2Q9H6S0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
YTHDC2Q9H6S0 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
YTHDC2Q9H6S0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
YTHDC2Q9H6S0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
YTHDC2Q9H6S0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
YTHDC2Q9H6S0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
YTHDC2Q9H6S0 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
YTHDC2Q9H6S0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
YTHDC2Q9H6S0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
YTHDC2Q9H6S0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
YTHDC2Q9H6S0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
YTHDC2Q9H6S0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
YTHDC2Q9H6S0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
YTHDC2Q9H6S0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
YTHDC2Q9H6S0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
YTHDC2Q9H6S0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
YTHDC2Q9H6S0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC27.58■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC27.58■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC27.58■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC27.57■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC27.57■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC27.57■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC27.56■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC27.56■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC27.56■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
YTHDC2Q9H6S0 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms