Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NXF3Q9H4D5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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