Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C2

ARV1, Protein ARV1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARV1Q9H2C2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARV1Q9H2C2 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARV1Q9H2C2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms