Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EHD4Q9H223 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EHD4Q9H223 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms