Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC8Q9H0W5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC8Q9H0W5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms