Protein–RNA interactions for Protein: Q9C093

SPEF2, Sperm flagellar protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEF2Q9C093 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPEF2Q9C093 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPEF2Q9C093 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPEF2Q9C093 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPEF2Q9C093 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPEF2Q9C093 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SPEF2Q9C093 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPEF2Q9C093 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPEF2Q9C093 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPEF2Q9C093 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPEF2Q9C093 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPEF2Q9C093 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPEF2Q9C093 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPEF2Q9C093 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPEF2Q9C093 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SPEF2Q9C093 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPEF2Q9C093 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPEF2Q9C093 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPEF2Q9C093 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SPEF2Q9C093 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPEF2Q9C093 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPEF2Q9C093 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPEF2Q9C093 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPEF2Q9C093 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SPEF2Q9C093 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPEF2Q9C093 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPEF2Q9C093 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPEF2Q9C093 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPEF2Q9C093 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPEF2Q9C093 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPEF2Q9C093 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPEF2Q9C093 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPEF2Q9C093 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPEF2Q9C093 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPEF2Q9C093 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPEF2Q9C093 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPEF2Q9C093 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SPEF2Q9C093 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SPEF2Q9C093 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPEF2Q9C093 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPEF2Q9C093 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPEF2Q9C093 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPEF2Q9C093 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPEF2Q9C093 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPEF2Q9C093 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPEF2Q9C093 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPEF2Q9C093 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPEF2Q9C093 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPEF2Q9C093 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPEF2Q9C093 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPEF2Q9C093 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPEF2Q9C093 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPEF2Q9C093 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SPEF2Q9C093 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPEF2Q9C093 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPEF2Q9C093 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPEF2Q9C093 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SPEF2Q9C093 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPEF2Q9C093 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPEF2Q9C093 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPEF2Q9C093 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPEF2Q9C093 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms