Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXR3

ERVK-6, Endogenous retrovirus group K member 6 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-6Q9BXR3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-6Q9BXR3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms