Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SALL3Q9BXA9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SALL3Q9BXA9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms