Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
HIGD2AQ9BW72 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms