Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBB2BQ9BVA1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBB2BQ9BVA1 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBB2BQ9BVA1 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBB2BQ9BVA1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBB2BQ9BVA1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBB2BQ9BVA1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBB2BQ9BVA1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBB2BQ9BVA1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBB2BQ9BVA1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBB2BQ9BVA1 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBB2BQ9BVA1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBB2BQ9BVA1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBB2BQ9BVA1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBB2BQ9BVA1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBB2BQ9BVA1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBB2BQ9BVA1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBB2BQ9BVA1 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBB2BQ9BVA1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBB2BQ9BVA1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TUBB2BQ9BVA1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TUBB2BQ9BVA1 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TUBB2BQ9BVA1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TUBB2BQ9BVA1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TUBB2BQ9BVA1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TUBB2BQ9BVA1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TUBB2BQ9BVA1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TUBB2BQ9BVA1 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TUBB2BQ9BVA1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TUBB2BQ9BVA1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TUBB2BQ9BVA1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TUBB2BQ9BVA1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TUBB2BQ9BVA1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TUBB2BQ9BVA1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TUBB2BQ9BVA1 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TUBB2BQ9BVA1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TUBB2BQ9BVA1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TUBB2BQ9BVA1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TUBB2BQ9BVA1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TUBB2BQ9BVA1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
TUBB2BQ9BVA1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TUBB2BQ9BVA1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TUBB2BQ9BVA1 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TUBB2BQ9BVA1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TUBB2BQ9BVA1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TUBB2BQ9BVA1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TUBB2BQ9BVA1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TUBB2BQ9BVA1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TUBB2BQ9BVA1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TUBB2BQ9BVA1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TUBB2BQ9BVA1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TUBB2BQ9BVA1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TUBB2BQ9BVA1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TUBB2BQ9BVA1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TUBB2BQ9BVA1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TUBB2BQ9BVA1 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TUBB2BQ9BVA1 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TUBB2BQ9BVA1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TUBB2BQ9BVA1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TUBB2BQ9BVA1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TUBB2BQ9BVA1 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TUBB2BQ9BVA1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TUBB2BQ9BVA1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TUBB2BQ9BVA1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TUBB2BQ9BVA1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TUBB2BQ9BVA1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TUBB2BQ9BVA1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TUBB2BQ9BVA1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TUBB2BQ9BVA1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TUBB2BQ9BVA1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TUBB2BQ9BVA1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TUBB2BQ9BVA1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TUBB2BQ9BVA1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TUBB2BQ9BVA1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TUBB2BQ9BVA1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TUBB2BQ9BVA1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TUBB2BQ9BVA1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TUBB2BQ9BVA1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TUBB2BQ9BVA1 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TUBB2BQ9BVA1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TUBB2BQ9BVA1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TUBB2BQ9BVA1 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TUBB2BQ9BVA1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TUBB2BQ9BVA1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TUBB2BQ9BVA1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TUBB2BQ9BVA1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TUBB2BQ9BVA1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TUBB2BQ9BVA1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TUBB2BQ9BVA1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TUBB2BQ9BVA1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TUBB2BQ9BVA1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TUBB2BQ9BVA1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TUBB2BQ9BVA1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TUBB2BQ9BVA1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TUBB2BQ9BVA1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TUBB2BQ9BVA1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TUBB2BQ9BVA1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TUBB2BQ9BVA1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TUBB2BQ9BVA1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TUBB2BQ9BVA1 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms