Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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NDUFAF3Q9BU61 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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NDUFAF3Q9BU61 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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NDUFAF3Q9BU61 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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NDUFAF3Q9BU61 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFAF3Q9BU61 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFAF3Q9BU61 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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