Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms