Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MESP1Q9BRJ9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms