Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms