Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EBF4Q9BQW3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms