Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ALS2CR12Q96Q35 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms