Protein–RNA interactions for Protein: Q96NB2

SFXN2, Sideroflexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN2Q96NB2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFXN2Q96NB2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFXN2Q96NB2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFXN2Q96NB2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFXN2Q96NB2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFXN2Q96NB2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFXN2Q96NB2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFXN2Q96NB2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFXN2Q96NB2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFXN2Q96NB2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFXN2Q96NB2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFXN2Q96NB2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFXN2Q96NB2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFXN2Q96NB2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFXN2Q96NB2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFXN2Q96NB2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SFXN2Q96NB2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFXN2Q96NB2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFXN2Q96NB2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SFXN2Q96NB2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFXN2Q96NB2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SFXN2Q96NB2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFXN2Q96NB2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFXN2Q96NB2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFXN2Q96NB2 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFXN2Q96NB2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFXN2Q96NB2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFXN2Q96NB2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SFXN2Q96NB2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SFXN2Q96NB2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFXN2Q96NB2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFXN2Q96NB2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFXN2Q96NB2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFXN2Q96NB2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SFXN2Q96NB2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFXN2Q96NB2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFXN2Q96NB2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFXN2Q96NB2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFXN2Q96NB2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFXN2Q96NB2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFXN2Q96NB2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFXN2Q96NB2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFXN2Q96NB2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFXN2Q96NB2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFXN2Q96NB2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFXN2Q96NB2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SFXN2Q96NB2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SFXN2Q96NB2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFXN2Q96NB2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFXN2Q96NB2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms