Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
JSRP1Q96MG2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
JSRP1Q96MG2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms