Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGD4Q96M96 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms