Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPNS2Q96L46 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPNS2Q96L46 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms