Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PGBD1Q96JS3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGBD1Q96JS3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms