Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC136Q96JN2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms