Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC7

TMCO6, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO6Q96DC7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMCO6Q96DC7 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms